Ako sam te dobro razumeno, i ako koristiš PHPMyadmin - ja bih POSLE PREGLEDA I DETALJNE KONTROLE TEMP tabele izbrisao originalnu tabelu a TEMP tabelu preimenovao (Rename table to:) u pravi naziv.
Tako da bi prekid na sajtu trajao kratko.
Ali ipak dobro promisli i probaj, za svaki slucaj.
Kusur