SpikeFun - Artificial Nervous System Demo

Pa, zar nije odlican screen saver

Potpis

Nebojsa Milanovic:
-Trumpa smatram vrhunskim predsednikom i voleo bih da živim u državi na čijem je on čelu
-Rusija ne laže, ne vodi osvajačke ratove
-Trump je svetla tačka u USA blatu
-Elon Musk, možda najpametniji i najtrezveniji Amerikanac

"SpikeFun je mali simulator bioloski-realisticnih neuronskih mreza", prva recenica
u prvom postu na temi, dakle upotrebljava se za simulaciju aktivnosti neurona i
mreza neurona (nervnih celija).

Mozda je dobar screen-saver, ali je CPU-killer :)

Potpis

oligofrenolog

Takodje nije los za grejanje za predstojecu zimu... kao i za podgrevanje caja, ako se casa stavi na izduvnik kod laptopa Vas napitak moze biti prijatne temperature za toplo uzivanje. Porucite vec danas - komplet SpikeFun + laptop, samo 499e!

Potpis

- Il n'est pas important qui, importe c'est quoi!

Yep - trenutno je glavna aplikacija grejanje uz screen saver :-)

v0.41 is out...

- Sada je moguce menjati render stil ("kockice" vs. cela mreza) sa F12 dok traje simulacija
- Dodao sam /DisableVbo opciju koja iskljucuje koriscenje OpenGL VBO-ova. Ova opcija moze biti korisna za 2 stvari:

a) Ako imate neku matoru Intel integrusu tipa GMA950... koja nema ljudsku podrsku za vertex-buffer-objekte
b) Ako se spikefun zali tokom kreiranja OpenGL scene na nedovoljno memorije

/DisableVbo ce, naravno, lose uticati na performance renderinga - ali moze posluziti kao fallback za mator hardver.

Sto se Wine-a i fontova tice - na zalost, nisam jos u stanju to da proverim posto Ubuntu live USB stick instalira Wine koji odbija da pokrene SpikeFun (tj. pokrene ga, ispise se (C) informacija - i tu stane)... malo sam izmenjao parametre oko kreiranja fontova, ali sumnjam da ce to pomoci.

Potpis

DigiCortex (ex. SpikeFun) - Cortical Neural Network Simulator:
http://www.digicortex.net/node/1 Videos: http://www.digicortex.net/node/17 Gallery: http://www.digicortex.net/node/25
PowerMonkey - Redyce CPU Power Waste and gain performance! - https://github.com/psyq321/PowerMonkey

nista se sa fontovima nije promenilo - i dalje nema txt-a

Potpis

arhimed
http://www.mysql.rs/ | http://elco.crsndoo.com/

Nista stavicu neki posten Linux na drugu masinu pa cemo videti...

Btw, sad se setih - pre par nedelja sam razmisljao o ubacivanju Freetype podrske medjutim za sada mi je to glupo posto je sama Freetype biblioteka veca od same aplikacije :-))

Potpis

DigiCortex (ex. SpikeFun) - Cortical Neural Network Simulator:
http://www.digicortex.net/node/1 Videos: http://www.digicortex.net/node/17 Gallery: http://www.digicortex.net/node/25
PowerMonkey - Redyce CPU Power Waste and gain performance! - https://github.com/psyq321/PowerMonkey

Hmm nikako mi ne polazi za rukom da nateram SpikeFun da radi pod Wine-om... ispise Copyright poruku i tu stane...

Probao Wine 1.2 i 1.3, na Ubuntu 10.04 i 11.stagod... sa virtuelnim desktopom i bez...

@Bogdane, koji Linux distro koristis i koji Wine?

Potpis

DigiCortex (ex. SpikeFun) - Cortical Neural Network Simulator:
http://www.digicortex.net/node/1 Videos: http://www.digicortex.net/node/17 Gallery: http://www.digicortex.net/node/25
PowerMonkey - Redyce CPU Power Waste and gain performance! - https://github.com/psyq321/PowerMonkey

Fedora 14, wine 1.3.24



instaliraj http://wiki.winehq.org/winetricks i iz njega dodaj cirefints, dotnet11, fontfix, dotnet30 i gecko ... i vidi sta jos ti se ucini zanimljivo :) .. trebalo bi da proradi sve ...

btw ja startam sa "wine start /unix SpikeFun.exe" tako da vidis na tom screenshot-u dobijem konzolu kao poseban program

Potpis

arhimed
http://www.mysql.rs/ | http://elco.crsndoo.com/

E thx - uspelo je sada i meni iz Ubuntu-a... pojma nemam kako :)

Nema ni kod mene teksta nigde... ali sad bar mogu da debagujem :)

Potpis

DigiCortex (ex. SpikeFun) - Cortical Neural Network Simulator:
http://www.digicortex.net/node/1 Videos: http://www.digicortex.net/node/17 Gallery: http://www.digicortex.net/node/25
PowerMonkey - Redyce CPU Power Waste and gain performance! - https://github.com/psyq321/PowerMonkey

Resio sam problem sa Linux-om sa verzijom 0.42 (dostupna)

Problem sa fontovima je bio bizaran - naime, wglUseFontOutlines() kreira displej liste u kojima se nalaze OpenGL pozivi za crtanje font-poligona i koje se onda zovu sa glCallLists() kada vam to treba...

Elem, unutar tih lista, Microsoft u svojoj ingenioznosti menja orijentaciju lica za izbacivanje (culling) koja je po defaultu suprotna od kazaljke na satu - verovatno je danas na Windowsu malo situacija kada su lica CW a ne CCW pa se problem nije video, dok je implementacija wglUseFontOutlines() u WINE-u ocigledno drugacija.

Resenje je prosto - pre zvanja glCallLists() potpuno iskljucim face-culling - a onda kada se zavrsi, ukljucim back-face culling i resetujem kriterijum za odbacivanje lica na GL_CCW (default). Ne svidja mi se ideja stalnog zivkanja OpenGL-a za ove gluposti, ali sta-je-tu-je...

Potpis

DigiCortex (ex. SpikeFun) - Cortical Neural Network Simulator:
http://www.digicortex.net/node/1 Videos: http://www.digicortex.net/node/17 Gallery: http://www.digicortex.net/node/25
PowerMonkey - Redyce CPU Power Waste and gain performance! - https://github.com/psyq321/PowerMonkey

Sada radi pod wine-om 1/1

Potpis

arhimed
http://www.mysql.rs/ | http://elco.crsndoo.com/

Hmm, sad gledam svoju poruku sto sam napisao pre ovog tvog odgovora... Nisam imao nameru da nipodastavam program niti tudji rad, to mi nije ni na kraj pameti. Samo sam napisao kvazi duhovit post. :)
AKO je bilo ko pogresno protumacio, evo ovo je disclaimer... :)

Inace, poslednja ver i dalje ima ludacke skokove FPS-a... mada average FPS izracunava korektno cini mi se.

Potpis

- Il n'est pas important qui, importe c'est quoi!

Pitanje jeste skroz na mestu - SpikeFun je za sada prilicno neupotrebljiv bilo sta osim za vizualizaciju slucajno uvezanih mreza.

Kako bude napredovao, bice moguce raditi i druge stvari :-)

Sto se skokova FPS-a tice, mislim da sam uspeo da ih reprodukujem na Core 2 masini ali nisam jos stigao da fixujem to ali ce biti reseno do sledece verzije...

Elem, v0.43 je izbacena, sada sa novom download stranom:

http://www.dimkovic.com/node/7

Sta je novo?

- 64 bitne verzije* (obicna i "sandy bridge") koje omogucavaju enormne simulacije
- Jos malo malih demoa (bat fajlovi)
- "HUD" style statistika u visualization pogledu (F11) - 2 video klipa dole je imaju
- Malo sredjen OpenGL rendering tako da se sada ne razbacuje sa nepotrebnim state-change pozivima GL funkcija

Evo kako izgleda novi "HUD" mode - sa sfernom topologijom:

[youtube]rNxSuA9F0jw&hd=1[/youtube]

Ili sa "kockastom":

[youtube]UWqfyOmsimg&hd=1[/youtube]


* Jedina prednost 64-bitnih verzija je mogucnost ogromnih simulacija koje zahtevaju vise od 4 GB RAM-a. Osim toga, nema nikakvih drugih prednosti, cak je i losija sto se performansi tice (od nekoliko pa i do 10-tak % !!!) tako da preporucujem 32-bitnu verziju osim za super-velike simulacije. Budite pazljivi sa ogromnim simulacija - stvarno su ogromne... 80x80x240 (1.5 miliona) ce komotno "pojesti" 5.4 GB fizicke memorije.

Velike simulacije moguce sa 64-bitnom verzijom vrlo verovatno nece raditi u VBO modu na bilo cemu osim najjacim karticama tako da, ako vidite gresku u logu, startujte SpikeFun sa /DisableVbo parametrom. To ce omoguciti da se simulacija renderuje, ali brzinom puza :)

Potpis

DigiCortex (ex. SpikeFun) - Cortical Neural Network Simulator:
http://www.digicortex.net/node/1 Videos: http://www.digicortex.net/node/17 Gallery: http://www.digicortex.net/node/25
PowerMonkey - Redyce CPU Power Waste and gain performance! - https://github.com/psyq321/PowerMonkey

Da li mi se cini na ovom klipu ili aktivni neuroni po sferi iscrtavaju polukruzne i/ili spiralne slike? Ne vidim da je takva aktivnost na kocki, od cega to zavisi?

Potpis

- Il n'est pas important qui, importe c'est quoi!

Mozda to sto sfera ima neurone samo po povrsini (inace bi bila lopta, jelde:) ) dok je kocka ispunjena.

Potpis

Nebojsa Milanovic:
-Trumpa smatram vrhunskim predsednikom i voleo bih da živim u državi na čijem je on čelu
-Rusija ne laže, ne vodi osvajačke ratove
-Trump je svetla tačka u USA blatu
-Elon Musk, možda najpametniji i najtrezveniji Amerikanac

U redu to sto je sfera, ali nekako se uvek prave "linije" u obliku polukruga ili pocetka spirale... nekako je uvek pravilno u tom obliku. Nema mestimicnih grupa nepravilnog oblika ili grupe koja zauzima neku povrsinu u obliku recimo amebe. :P

Potpis

- Il n'est pas important qui, importe c'est quoi!

@mr.ako - Shadowed je u pravu, razlog drugacijeg izgleda je zbog samog oblika mreze. U slucaju sfere prakticno nema trece dimenzije posto su svi neuroni rasporedjeni po povrsini.

Da je u pitanju lopta, ponasanje (tj. prostiranje akcionih potencijala) bi bilo identicno kocki.

Propagacija zavisi ponajvise od geometrije, duzine aksona i proporcije inhibitornih i pobudjujucih neurona. Simulacija na sferi koja je na videu ima izuzetno kratke aksone.

Startuj SpikeFun bez demo moda (bez parametara u komandnoj liniji), zatim izaberi sferu od 16mm sa 32768 neurona, i ostavi default parametre - videces da je ponasanje skroz drugacije.

Potpis

DigiCortex (ex. SpikeFun) - Cortical Neural Network Simulator:
http://www.digicortex.net/node/1 Videos: http://www.digicortex.net/node/17 Gallery: http://www.digicortex.net/node/25
PowerMonkey - Redyce CPU Power Waste and gain performance! - https://github.com/psyq321/PowerMonkey

Dimke ne rade ti ove 64bit verzije :


Dobio sam novu masinu na poslu (intel i5 sandy bridge) i 8 GB RAMA pa rek'o da vidim oce li izdrzati spike attack :)

Treba li neki dodatni binaries da instaliram ?

Potpis

Viva lollapalooza

Isti problem sa x64 verzijom.

Argh... prokleti kompajler...

Znam sta je, probacu da sredim to do sutra posto sam u USA trenutno. Sorry...

Potpis

DigiCortex (ex. SpikeFun) - Cortical Neural Network Simulator:
http://www.digicortex.net/node/1 Videos: http://www.digicortex.net/node/17 Gallery: http://www.digicortex.net/node/25
PowerMonkey - Redyce CPU Power Waste and gain performance! - https://github.com/psyq321/PowerMonkey