C99 je C, a ne C++ standard. Mada unosi interesantne novine, ima jednu veliku manu, a to je da ruši princip po kome je C podskup C++ a, i po kome je svaki C program istovremeno i C++ program. Mada odbor za C++ standardizaciju namerava da u iduću verziju C++ a ugradi što više C99 novina, u nekim slučajevima to jednostavno neće biti moguće.
Posebno je zanimljivo da izgleda ni Dennis M. Ritchie, tvorac C-a nije zadovoljan C99 standardom.