Problem koji opisuješ nema veze sa .NET-om, već sa činjenicom da si prešla sa kompajlera koji nije u skladu sa standardom na kompajler koji jeste u skladu sa standardom.
Da ne tupim mnogo, počni tako što ćeš da zameniš
Code:
#include <fstream.h>
sa
Code:
#include <fstream>
using namespace std;