Ono što hoćeš reći je da priključiš sigurno ispravnog (probano na nekoj drugoj mašini) PS/2 miša na "zeleni" PS/2 konektor, upališ mašinu (PS/2 uprkos uvreženom mišljenju generalno nije hot-plug interfejs) i Windows ne vidi tog miša?
U BIOS-u i ne bi trebalo da bude bilo šta posebno o PS/2 port(ovima) osim eventualno podešavanje interrupt-a. Doduše neki BIOS setup-i imaju opcije kao PS/2 mouse enable/disable (isto i za keyboard) pa pogledaj da nisu disabled.
USB support ne diraj to će ti samo isključiti USB support na ploči kako mu i ime kaže :)
Ako ništa od navedenog ne djeluje nabavi bilo kakav live linux i isto probaj i sa njim. Ako ne uspije probaj update BIOS-a za matičnu (naravno na svoju odgovornost!).