Ovo je i mene interesovalo. Izgleda da je najlaksi nacin naci providnu temu za cursor (potrazi 'transparent xcursor' ili tako nesto)
Isto tako na
http://wiki.x.org/wiki/AdvancedTopicsFAQ ima nesto na ovu temu, ali mora da se kompajlira (a uz to izgleda radi samo sa 'golim' X, bez wm)
Sve u svemu za sada nisam nasao elegantno resenje, sam pointer je direktno vezan za X.