zavisi
ako ugasis mysql i iskopiras datadir napravices bekap. vracas podatke samo "sve" dakle ne mozes odatle da vratis samo deo
ako ne ugasis mysql i iskopiras datadir imas bekap koji ne radi
ako koristis SAMO myisam, mozes da koristis skript mysqlhotcopy (nalazi ti se u bin dir-u ) on moze da iskopira myisam tabele dok mysql radi (tako sto ce da zakljuca tabele za pisanje, flushne ih na disk, iskopira gde hoces i onda otkljuca)
za innodb mozes da koristis i mylvmbackup ako ti je datadir na lvm-u mada nije bas 10000% siguran, desava se da innodb ne bude bas 100% kako valja pa da mora radis recovery
ako koristis i innodb jedini pravilan nacin za kopiranje date je da koristis mysql enterprise backup (nije open source, nije free, mozes da ga skines i testiras sa
https://edelivery.oracle.com/ - pa da ako odlucis da ti treba kontaktiras sales - ta verzija koju skines sa edelivery je 100% funkcionalna, pitanje je samo licence)
sve u svemu mysql enterprise backup ti je najbolje resenje, podrzava i inkrementalni bekap i slicno, jedino sto na zalost nije foss resenje.
da ponovim, ako mysql-u koji "radi" samo iskopiras fajlove dobices beskoristan sadrzaj
obrati paznju da vecina ovih resenja podrazumeva mysql na linux/bsd/osx/solaris/*x operativnom sistemu, mysql na winblowsima mozes da bekapujes na zalost ili sa meb-om ili sa mysqldump-om i to je to .. sve ostalo mozes da zaboravis