Problem je u konfiguraciji Apache. Treba da sredis virtual host.
NameVirtualHost 192.168.0.1
<VirtualHost 192.168.0.1>
ServerName poddomena.domena.com
ServerPath /poddomena
DocumentRoot /var/www/html/poddomena
</VirtualHost>
<VirtualHost 192.168.0.1>
ServerName domena.com
ServerPath /
DocumentRoot /var/www/html/domena
</VirtualHost>
PS. Samo promeni vrednosti IP i nazive u stvarne koje imas :-)
Nahrani prasiće ne diraj dugmiće !!!